Esistono discussioni per identificare questa pianta, distinguendola da una forma a spine più corte di M.petterssonii – ci sono inoltre piante in circolazione identificate come M.obscura, riferibili a M.wagneriana – Hunt riferisce antesbergeriana a questa specie, ma essa sembra più vicina a M.petterssonii – altre piante identificate come M.wagneriana var. tortulospina sono una ulteriore attraente variante.
Mammillaria obscura è un taxa senza riferimento alla località se non
proveniente dal Messico e probabilmente riferito a M.petterssonii – Craig la allinea a M.wagneriana
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