le alghe si sviluppano per la presenza di funghi e batteri, sono dovute quindi all'ambiente che crei, direi perfetto per loro (umidità e temperatura).
le cose sono 2, o meglio ancora puoi farle entrambe, sterilizzare tutto in forno a 200 C° per almeno 15 minuti, oppure utilizzare un funghicida idoneo.
attualmente puoi tentare di arieggiare il più possibile e eliminarle manualmente.
per la concimazione se hai già utilizzato della terra nella semina direi che è quasi inutile, ma comunque dopo un mesetto e mezzo un pò di concime adatto puoi darlo!
la pomice in superficie è da evitare poichè alimenta non poco le alghe.
Per eliminarle,basta tenere asciutta la composta per qualche gg , compatibilmente con le dimensione delle plantule!
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